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腫瘤基因檢測(cè)助力精準(zhǔn)癌癥預(yù)防治療

醫(yī)學(xué)資訊 | 閱讀量:

作為世界上最好的癌癥中心之一,比弗利山莊癌癥中心(BHCC)在癌癥預(yù)防、診斷、治療、護(hù)理等各領(lǐng)域都走在國(guó)際前列!BHCC致力于精準(zhǔn)癌癥醫(yī)療的實(shí)施,通過(guò)與多家權(quán)威的腫瘤基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)合作,利用先進(jìn)的腫瘤基因檢測(cè)技術(shù)和大數(shù)據(jù)分析能力為癌癥患者提供高等級(jí)的醫(yī)學(xué)循證依據(jù),實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的癌癥風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、類別診斷、治療優(yōu)化等。其中,美國(guó)最大的臨床實(shí)驗(yàn)室之一“ GenPath ”就是BHCC的重要合作伙伴之一。

GenPath是一個(gè)由CLIA和CAP認(rèn)證的國(guó)家腫瘤診斷實(shí)驗(yàn)室,在癌癥診斷技術(shù)方面無(wú)與倫比,可為癌癥患者提供完整的疾病檢測(cè),包括從常規(guī)臨床檢測(cè)、特殊凝固測(cè)試到針對(duì)腫瘤基因序列及遺傳性癌癥綜合征的復(fù)雜基因組檢測(cè)。

 

基因檢測(cè),遺傳性基因綜合癥

 

GenPath遺傳性癌癥基因檢測(cè)——防癌,從基因開始

越來(lái)越多的基因變異被證實(shí)與各種形式的癌癥有關(guān)聯(lián),GenPath 的遺傳性癌癥基因檢測(cè)服務(wù)(Hereditary Cancer Panels),不局限于BRCA(乳腺癌易感基因),而是提供更為廣泛的癌癥基因檢測(cè)項(xiàng)目,以滿足不同個(gè)體的需求。至今已有超過(guò)45000人通過(guò)GenPath來(lái)檢測(cè)有害的基因變異——那些可加大患癌風(fēng)險(xiǎn)的變異。

(備注:基因Panel是指將若干基因?qū)?yīng)的探針設(shè)計(jì)到同一張捕獲芯片上以捕獲目標(biāo)DNA并用于后續(xù)的基因測(cè)序)

據(jù)ACOG統(tǒng)計(jì),近三年歐美國(guó)家的癌癥發(fā)病率和死亡率明顯下降,許多潛在的癌癥“候選人”,尤其是有癌癥家族史的人群,通過(guò)進(jìn)行遺傳性癌癥基因檢測(cè),精確獲悉了相關(guān)癌癥的患病幾率和預(yù)防建議,提前采取了預(yù)防措施,從而避免癌癥侵襲,例如乳腺癌預(yù)防性切除使得高癌風(fēng)險(xiǎn)患者發(fā)病率下降了60%,卵巢癌發(fā)病率下降了85%。

值得一提的是,GenPath針對(duì)中國(guó)民眾提供遠(yuǎn)程檢測(cè)服務(wù),基因檢測(cè)試劑盒可在美國(guó)下單后托運(yùn)回國(guó)進(jìn)行遠(yuǎn)程基因檢測(cè),1個(gè)月后通過(guò)遠(yuǎn)程視頻會(huì)診獲取最終的基因檢測(cè)結(jié)果和專業(yè)評(píng)估建議。

GenPath第二代基因測(cè)序,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)癌癥醫(yī)療。

GenPath 實(shí)驗(yàn)室的細(xì)胞遺傳學(xué)博士Robert Daber帶領(lǐng)了一支精銳科研團(tuán)隊(duì),設(shè)計(jì)出了一項(xiàng)專利技術(shù)——OnkoSight,用于惡性血液病和實(shí)體腫瘤的二代基因測(cè)序,旨在為患者制定精準(zhǔn)的癌癥治療及管理方案?;诙鷾y(cè)序的OnkoSight Panels 所涵蓋的基因項(xiàng)目具備明確的治療價(jià)值、診斷價(jià)值或預(yù)后價(jià)值,并與末期臨床試驗(yàn)適用性相關(guān),每個(gè)腫瘤特殊Panel都包含了美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)推薦的基因。

 

onkosight,精準(zhǔn)基因檢測(cè)

 

通過(guò)OnkoSight 基因Panels檢測(cè)可以對(duì)癌癥患者進(jìn)行精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)分型,確認(rèn)對(duì)治療具有重要指導(dǎo)意義的基因突變,包括FDA批準(zhǔn)的腫瘤治療藥物的作用靶點(diǎn),以及正在進(jìn)行的腫瘤臨床試驗(yàn)的藥物靶點(diǎn),為后續(xù)治療提供重要參考,也幫助某些患者匹配到適合的臨床試驗(yàn)。

OnkoSight基因Panels檢測(cè)僅限在美國(guó)本土進(jìn)行,技術(shù)流程如下:

 

OnkoSight操作流程,技術(shù)流程

 

1、組織提取

對(duì)于實(shí)體腫瘤,GenPath實(shí)驗(yàn)室分塊檢索部門將協(xié)調(diào)所有OnkoSight病例標(biāo)本的檢索,并確保分塊返回。

2、組織復(fù)查

針對(duì)實(shí)體腫瘤,將由GenPath一名分子病理學(xué)家核查所有病例的每張H&E幻燈片以確保:①腫瘤存在;②腫瘤細(xì)胞核占細(xì)胞> 10%;③組織檢測(cè)部分是最適宜的。

3、DNA離析

對(duì)于實(shí)體腫瘤,將樣本溫育過(guò)夜以增加FFPE組織的DNA產(chǎn)量。對(duì)于小樣本,GenPath實(shí)驗(yàn)室將延長(zhǎng)溫育時(shí)間以最大程度提高從樣本分離的DNA數(shù)量。

4、DNA質(zhì)量控制

對(duì)于實(shí)體腫瘤來(lái)說(shuō),組織固定可以破壞DNA結(jié)構(gòu)。許多競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手對(duì)所有標(biāo)本制作了基因Panel卻忽視了DNA的質(zhì)量。從另一方面來(lái)說(shuō),GenPath公司設(shè)計(jì)了嚴(yán)格的質(zhì)量控制體系來(lái)確保DNA的質(zhì)量,且數(shù)量上就足以提高總成功率。如果GenPath的科學(xué)家們認(rèn)為DNA數(shù)量不足,將會(huì)于測(cè)試早期與客戶進(jìn)行溝通。

5、庫(kù)制備

對(duì)于實(shí)體瘤檢測(cè),GenPath實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)建了一項(xiàng)專門的技術(shù),并且已進(jìn)行過(guò)優(yōu)化,以此解決DNA的低輸入量問(wèn)題。

這些自定義庫(kù)為GenPath實(shí)驗(yàn)室提供方案,用以解決小份且質(zhì)量較差的標(biāo)本,同時(shí)為創(chuàng)建現(xiàn)有測(cè)試產(chǎn)品提供了靈活的空間。

6、測(cè)序

OnkoSight骨髓疾病和實(shí)體瘤基因Panel將在Illumina公司平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。這項(xiàng)技術(shù)保證了基因插入和基因刪除上較低的假陽(yáng)性率,且從兩個(gè)方向上對(duì)每個(gè)DNA分子進(jìn)行測(cè)序,相比其他競(jìng)爭(zhēng)性產(chǎn)品的單個(gè)測(cè)序方向來(lái)說(shuō)提高了精確度。

7、生物信息學(xué)

GenPath生物信息學(xué)通過(guò)ClearView分析學(xué)進(jìn)行傳遞,后者為一套專門從定序器上讀取數(shù)以百萬(wàn)計(jì)基因突變的演算法。ClearView分析學(xué)是由臨床醫(yī)生設(shè)計(jì)的,經(jīng)由嚴(yán)謹(jǐn)?shù)馁|(zhì)量體系以提高OnkoSight的精確性,并減少報(bào)告生成的假陰性。大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室使用現(xiàn)成的基因Panel和生物信息學(xué)軟件;然而沒(méi)有專門的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)驗(yàn)證上述信息學(xué)結(jié)果的精確性。

8、報(bào)告生成

OnkoSight報(bào)告旨在為優(yōu)化患者管理提供臨床相關(guān)信息。報(bào)告將會(huì)明確歸類為異常(ABNORMAL)、正常(NORMAL)、變化(VARIANT)或者意義不明(UNKNOWN SIGNIFICANCE)。

ClearView分析學(xué)監(jiān)測(cè)到的每個(gè)變化值將由動(dòng)態(tài)知識(shí)庫(kù)加以注釋。每天晚上,此數(shù)據(jù)庫(kù)將與NCCN指南、預(yù)后關(guān)聯(lián)分析、可行治療和臨床試驗(yàn)保持同步更新,以保證GenPath生成最新報(bào)告且具有可行性。臨床試驗(yàn)的選定也是依據(jù)腫瘤患者出現(xiàn)的特定基因突變。

9、Onkosight門戶網(wǎng)站

每個(gè)訪問(wèn)Onkosight的客戶同樣可以訪問(wèn)Onkosight醫(yī)生門戶網(wǎng)站,以此來(lái)訪問(wèn)自己的基因Panel以監(jiān)測(cè)患者基因檢測(cè)結(jié)果。通過(guò)OnkoSight醫(yī)生門戶網(wǎng)站,醫(yī)生可以搜索報(bào)告和參考文獻(xiàn),并對(duì)臨床試驗(yàn)進(jìn)行實(shí)時(shí)匹配。

10、人群分析

由于可以與所有患者人群相聯(lián)系,醫(yī)生還可通過(guò)OnkoSight門戶網(wǎng)站追蹤患者結(jié)果。運(yùn)用專門的分析工具,醫(yī)生可以很容易地確定患者是否符合新臨床試驗(yàn)入組標(biāo)準(zhǔn)。GenPath公司同樣樂(lè)意與客戶相關(guān)的項(xiàng)目和出版物共同合作。

2018-11-20 16:29

好醫(yī)友小編