新檢測方法可更快評估前列腺癌轉移風險
前列腺癌患者(無論新確診或經治)的轉移風險,決定了該選擇保守治療,還是積極治療。對于前列腺癌,原發(fā)腫瘤的生長或擴散由基因組部分的擴增或缺失驅動,稱為拷貝數改變(CNAs)。
近日,《分子診斷雜志》介紹了一種新的評估CNAs的方法,這種方法比其他診斷技術更便宜、更快且可重復,需要的組織也更少,有望顯著增強前列腺癌轉移風險評估的潛力。
轉移約占前列腺癌的16%,轉移性前列腺癌占所有男性癌癥死亡人數的8%。在診斷時作出準確的預測,可確定哪些人有轉移風險,哪些人將受益于積極治療。前列腺組織或血液中CNAs的檢測,可發(fā)現疾病進展的跡象。擴增和缺失的基因是治療侵襲性前列腺癌的新靶點。
美國紐約阿爾伯特愛因斯坦醫(yī)學院病理學系主任研究員Harry Ostrer解釋說:“我們已證明,通過新一代拷貝數改變(NG-CNA)檢測,可以快速準確地檢測到CNAs。一方面,它可確保轉移性前列腺癌的患者在診斷時進行積極治療;另一方面,為惰性前列腺癌患者提供主動監(jiān)測(而非過度治療)的理論基礎?!?/p>
NG-CNA是一種靶向擴增測序技術,能夠分析194個基因組區(qū)域的902個基因組位點。與微陣列比較基因組雜交技術(CGH)相比,NG-CNA可以更快地處理樣品,降低成本。
“例如:使用NG-CNA,每個樣本的DNA提取、文庫制備和測序試劑的成本可能是20~40美元,而全基因組測序的成本接近1000美元?!毖芯空哒f。
“事實上,大規(guī)模多路復用技術,如NG-CNA,提供了一種個性化醫(yī)療工具,且成本僅為傳統(tǒng)全基因組測序的一小部分?!毖芯空弑硎尽?/p>
NG-CNA的另一個實際優(yōu)點在于,其結果比全基因組測序更容易破譯。新的分析方法允許在一次運行中處理成百上千的樣品,通常周轉時間為36小時。與全基因組測序相比,用NG-CNA分析評估的樣本所需的數據存儲更少,因而能大大提高可及性--根據需要從大型實驗室普及到更小、資源更有限的獨立實驗室。
NG-CNA分析的另一個優(yōu)點是,它能處理比其他技術所需的更少的材料(低至12.5 ng),從而可以對細胞株、手術樣本和活檢組織進行分析。CNA方法還提供了一個單獨的平臺,可以將其他測序測試(如輔助診斷測試)合并到該平臺上。
“我們相信,在標準的癌癥基因測試平臺上添加NG-CNA檢測方法,可識別侵襲性腫瘤和預測靶向治療反應的基因突變,從而有助于癌癥的個體化治療?!毖芯空咧赋?/p>
參考資料:Faster, cheaper test can help predict risk of metastasis in prostate cancer patients.
2018-11-07 17:20
好醫(yī)友小編
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