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近年來，癌癥精準(zhǔn)醫(yī)療備受矚目。為患者量身定制個(gè)性化治療方案，是腫瘤專家們孜孜以求的。

日前，密歇根大學(xué)羅蓋爾癌癥中心的研究人員開發(fā)了一種新的分析工具，它結(jié)合了多個(gè)數(shù)據(jù)集，從龐大的信息中做篩選，以指導(dǎo)癌癥研究和治療。

該工具稱為TransPRECISE，使用了來自癌癥蛋白質(zhì)組圖譜中收集的31種癌癥類型的7714名患者樣本的數(shù)據(jù)。他們將這些數(shù)據(jù)與來自MD 細(xì)胞系項(xiàng)目的640個(gè)癌細(xì)胞系及典型癌癥模型系統(tǒng)中藥物敏感性基因組學(xué)的481種藥物的藥物敏感性數(shù)據(jù)相結(jié)合。

圖示：多種癌癥類型所涉及的多種途徑(來源：Michigan Medicin)

密歇根大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)博士Veerabhadran Baladandayuthapani說：“我們希望綜合來自癌癥細(xì)胞系、患者和藥物分析的三個(gè)數(shù)據(jù)集，來了解最能代表這些腫瘤的正確的臨床前模型。”

好在，這是一個(gè)非常動(dòng)態(tài)的過程。整個(gè)系統(tǒng)安裝后，隨著新患者或新數(shù)據(jù)的增加，相應(yīng)的數(shù)據(jù)也可以繼續(xù)增加。

該工具基于研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建的早期模型“PRECISE”。他們著眼于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)，創(chuàng)建了一個(gè)模型來研究患者個(gè)體腫瘤的分子結(jié)構(gòu)發(fā)生了什么變化。TransPRECISE增加了來自細(xì)胞系和藥物敏感性的數(shù)據(jù)，有助于將癌細(xì)胞生物學(xué)轉(zhuǎn)化為藥物發(fā)現(xiàn)。

Rogel癌癥中心癌癥數(shù)據(jù)科學(xué)共享資源主任Baladandayuthapani博士說：“現(xiàn)在，這些病人涉及成千上萬的腫瘤，我們可以評(píng)估這些藥物的潛在治療效果。關(guān)鍵在于開發(fā)一種分析工具來實(shí)現(xiàn)。”

研究人員通過比較患者數(shù)據(jù)中已知的藥物反應(yīng)和臨床結(jié)果來驗(yàn)證該工具。TransPRECISE可識(shí)別各個(gè)腫瘤之間蛋白質(zhì)的差異，并將其準(zhǔn)確地與患者的實(shí)際預(yù)后聯(lián)系起來。此外，他們研究了幾種預(yù)測(cè)潛在藥物靶標(biāo)的途徑。這產(chǎn)生了與當(dāng)前治療建議或臨床試驗(yàn)中正在測(cè)試的目標(biāo)相似的結(jié)果，例如伊布替尼(Ibruutinib)治療BRCA陽性乳腺癌，拉帕替尼(Lapatinib)治療結(jié)腸癌。

Baladandayuthapani博士表示：“我們擁有海量數(shù)據(jù)，通過這個(gè)分析工具可以對(duì)其進(jìn)行深入研究以使之更具參考價(jià)值，以便腫瘤學(xué)家能夠理解，從而做出更好的治療選擇。”

條條大路通羅馬，另一群科學(xué)家對(duì)此展開了不同的探索。

13年前，來自印度的電子工程師兼生物學(xué)家Shireen Vali博士與Taher Abbasi博士開始了一項(xiàng)開創(chuàng)性的工作，試圖通過計(jì)算機(jī)模擬來預(yù)測(cè)藥物的療效。他們的研究成果“腫瘤治療應(yīng)答指數(shù)檢測(cè)(TRI)”產(chǎn)品目前已被全球腫瘤學(xué)家評(píng)估使用。TRI通過人工智能驅(qū)動(dòng)的生物模擬，分析可能的治療方法，并進(jìn)行排名，幫助醫(yī)生為癌癥患者選擇最有效的治療方法。

Abbasi博士表示：“癌癥治療的個(gè)性化至關(guān)重要。在癌癥中，每個(gè)病人的基因組特征都是完全不同的。在這種情況下，一種放之四海而皆準(zhǔn)的方法是行不通的。而我們的技術(shù)，可以在試驗(yàn)藥物用于人體測(cè)試之前，識(shí)別出可能對(duì)試驗(yàn)藥物有良好反應(yīng)的患者?，F(xiàn)實(shí)中，大多數(shù)癌癥療法只對(duì)某些患者有效，我們可以運(yùn)用建模能力來預(yù)測(cè)要靶向什么受體?要靶向什么指征?有多少比例的人會(huì)有反應(yīng)?為臨床試驗(yàn)選擇可能的反應(yīng)者，以及挽救藥物或改換藥物用途。”

目前，TRI正在擴(kuò)展新的癌癥適應(yīng)癥和藥物種類，以解決臨床未竟的需求。

Cellworks Group已與好醫(yī)友達(dá)成戰(zhàn)略合作，授予TRI在華獨(dú)家代理權(quán)。目前，已有多名治療本已陷入絕境的癌癥患者，受益于TRI。